RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 TDO2P48775 406 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CDK7P50613 346 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GJA9P57773 515 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TNFAIP2Q03169 654 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 KLRC3Q07444 240 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ITGA7Q13683 1181 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TTLL4Q14679 1199 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RASIP1Q5U651 963 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NSMFQ6X4W1 530 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 HERVK_113Q902F9 699 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC17Q96LX7 622 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 UIMC1Q96RL1 719 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 RNF146Q9NTX7 359 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ELP1O95163 1332 aa5.66□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM232C9JQI7 657 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CSPG5O95196 566 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CD4P01730 458 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 NEFLP07196 543 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 BMP1P13497 986 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CST5P28325 142 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GRM5P41594 1212 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 EPHA4P54764 986 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GDF10P55107 478 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 KCTD1Q719H9 257 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GJD3Q8N144 294 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 CEP95Q96GE4 821 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 MYO19Q96H55 970 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ACAD9Q9H845 621 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 AK5Q9Y6K8 562 aa5.65□□□□□ -1.5
TMLHE-202ENST00000369439 GRIN2DO15399 1336 aa5.65□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 SCN5AQ14524 2016 aa5.65□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.65□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 MYH4Q9Y623 1939 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 LCHNA4D1U4 455 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 M0R2C6 588 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 TNFRSF10BO14763 440 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 BMP3P12645 472 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 MCCP23508 829 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 FSHRP23945 695 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 NNTQ13423 1086 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC96Q2M329 555 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 SLFN13Q68D06 897 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 Q6ZNB5 142 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 COPS5Q92905 334 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 KATNBL1Q9H079 304 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 TNKSO95271 1327 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.64□□□□□ -1.51
TMLHE-202ENST00000369439 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms