RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 IDEP14735 1019 aa22.92■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PTPN18Q99952 460 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PORCNQ9H237 461 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.91■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 CCNA1P78396 465 aa22.91■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.91■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 PRCPP42785 496 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 LXNQ9BS40 222 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 MED15Q96RN5 788 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.9■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 FANCLQ9NW38 375 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.9■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.89■■□□□ 1.26
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TRIM4-202ENST00000354241 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.89■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 HPS3Q969F9 1004 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 B4DLN1 442 aa22.88■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 ADSSL1Q8N142 457 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 NACC1Q96RE7 527 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 PANK4Q9NVE7 773 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.88■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.87■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 COBLO75128 1261 aa22.87■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 ICAM3P32942 547 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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TRIM4-202ENST00000354241 FGD4Q96M96 766 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.86■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 WDR81Q562E7 1941 aa22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PSMA7O14818 248 aa22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRIM4-202ENST00000354241 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.85■■□□□ 1.25
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