RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYNE2-201ENST00000341472 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE2-201ENST00000341472 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE2-201ENST00000341472 C6orf50Q9HD87 102 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE2-201ENST00000341472 MEIS1O00470 390 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 SREBF1P36956 1147 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 KCNJ6P48051 423 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PKN1Q16512 942 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 MCTP2Q6DN12 878 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 GLG1Q92896 1179 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PHKBQ93100 1093 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 SDF4Q9BRK5 362 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ESYT2A0FGR8 921 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ARP10275 920 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 IFNAR1P17181 557 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 GNA11P29992 359 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ARHGAP4P98171 946 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 IKBKEQ14164 716 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 NTRK3Q16288 839 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ERAP1Q9NZ08 941 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 NRCAMQ92823 1304 aa23■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 LGR5O75473 907 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 MBTPS1Q14703 1052 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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SYNE2-201ENST00000341472 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 EMSYQ7Z589 1322 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 NID2Q14112 1375 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 A0A0C4DFX4 3053 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 EFCAB14O75071 495 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PPFIA3O75145 1194 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 CAND2O75155 1236 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 MARK3P27448 753 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ADAM17P78536 824 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 AZI2Q9H6S1 392 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 NFASCO94856 1347 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 CYP3A4P08684 503 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PPFIA1Q13136 1202 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 BICD2Q8TD16 824 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 CA3P07451 260 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ACTR2P61160 394 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 TCTN1Q2MV58 587 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE2-201ENST00000341472 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SYNE2-201ENST00000341472 CPLX1O14810 134 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 ADAMTS3O15072 1205 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 TLL1O43897 1013 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 IGFBP4P22692 258 aa22.95■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 SEPT8Q92599 483 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 PCYT2Q99447 389 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 FAM86B1E9PN63 330 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 CTSHP09668 335 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 STAT5BP51692 787 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 DEFB103AP81534 67 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 ADGRE1Q14246 886 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 GRIK4Q16099 956 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 FAM26DQ5JW98 314 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 ATG7O95352 703 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 INSRRP14616 1297 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 NLRP5P59047 1200 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 RPAINQ86UA6 219 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 RSPH3Q86UC2 560 aa22.93■■□□□ 1.26
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