RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 TNFAIP2Q03169 654 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 LRRC41Q15345 812 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 FAM71BQ8TC56 605 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RMDN3Q96TC7 470 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MGARPQ8TDB4 240 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 POLIQ9UNA4 740 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 NCAPD2Q15021 1401 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MCF2LO15068 1137 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ACTN1P12814 892 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TXNRD1Q16881 649 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GUCY2FP51841 1108 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TTLL4Q14679 1199 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DPH5Q9H2P9 285 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.49■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CACNB3P54284 484 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 IQCB1Q15051 598 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PTPROQ16827 1216 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CHD1O14646 1710 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DENND3A2RUS2 1198 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 HLFQ16534 295 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.076e-7■□□□□ 8.7
TRIM25-201ENST00000316881 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SPDYE6P0CI01 402 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PHKA2P46019 1235 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MTMR1Q13613 665 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 URGCPQ8TCY9 931 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CYP27B1O15528 508 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PRPSAP2O60256 369 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ZBBXA8MT70 800 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DPYSL4O14531 572 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GPC4O75487 556 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 INHBAP08476 426 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SLFN14P0C7P3 912 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RAPH1Q70E73 1250 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.48■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 FDX1P10109 184 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 JADE1Q6IE81 842 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DDIT3P35638 169 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 BRD3Q15059 726 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GDAP1Q8TB36 358 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CD58P19256 250 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ZBTB5O15062 677 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 LRRN2O75325 713 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KRT1P04264 644 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 PCK1P35558 622 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RASSF7Q02833 373 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ASPHQ12797 758 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 HAUS8Q9BT25 410 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 ABCB11O95342 1321 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 A0A087WWV3 80 aa15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRIM25-201ENST00000316881 EHHADHQ08426 723 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms