RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MDM1Q8TC05 714 aa24.83■■□□□ 1.57
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.81■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.8■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRP5O75197 1615 aa24.8■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.8■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.8■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR52Z1P0C646 297 aa24.78■■□□□ 1.56
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSG101Q99816 390 aa24.78■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HLFQ16534 295 aa24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SV2BQ7L1I2 683 aa24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PGM2Q96G03 612 aa24.77■■□□□ 1.56
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