RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300961.10

JSRP1-201, Transcript of junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene JSRP1, Length 1,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1-201ENST00000300961 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 WNT8BQ93098 351 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 IL23AQ9NPF7 189 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 NFASCO94856 1347 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 WDR81Q562E7 1941 aa24.27■■□□□ 1.48
JSRP1-201ENST00000300961 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 M0R2N6 131 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PRR16Q569H4 304 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 TMEM240Q5SV17 173 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ZNF365Q70YC5 407 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 VWCEQ96DN2 955 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 FOSBP53539 338 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ACTR2P61160 394 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 TBCKQ8TEA7 893 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PCYT2Q99447 389 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.25■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PITPNM1O00562 1244 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 CCNE2O96020 404 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 MARK3P27448 753 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 CIITAP33076 1130 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 BFSP2Q13515 415 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 RETREG2Q8NC44 543 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 OXER1Q8TDS5 423 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 LENG9Q96B70 501 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 SETD4Q9NVD3 440 aa24.24■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 SLC34A2O95436 690 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 HOXC8P31273 242 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PTK7Q13308 1070 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 GALNT17Q6IS24 598 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 CAGE1Q8TC20 777 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 GLG1Q92896 1179 aa24.23■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 GBF1Q92538 1859 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 EMSYQ7Z589 1322 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 TREHO43280 583 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 LGR5O75473 907 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 TDP2O95551 362 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 IQCF3P0C7M6 154 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 XBP1P17861 261 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 INF2Q27J81 1249 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 WASF1Q92558 559 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.22■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 USP11P51784 963 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 SERINC5Q86VE9 423 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.21■■□□□ 1.47
JSRP1-201ENST00000300961 MSH4O15457 936 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 FGBP02675 491 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 CKBP12277 381 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 SELPP16109 830 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 RBL2Q08999 1139 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 RABEP1Q15276 862 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 GJA10Q969M2 543 aa24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 FAM205CA6NFA0 338 aa24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 ATG7O95352 703 aa24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 RASIP1Q5U651 963 aa24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 AZI2Q9H6S1 392 aa24.19■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 ADAM17P78536 824 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 PPFIA1Q13136 1202 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 NR5A1Q13285 461 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 GPNMBQ14956 572 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 Q7L0L9 218 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 HERVK_113Q902F9 699 aa24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
JSRP1-201ENST00000300961 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms