RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR23AA6NEV1 266 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QZ92 97 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 STAM2O75886 525 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CSPG5O95196 566 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CFBP00751 764 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CCND2P30279 289 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NBL1P41271 181 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NRIP1P48552 1158 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR3Q13615 1198 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MIER1Q8N108 512 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKS1AQ92625 1134 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ESR2Q92731 530 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT8BQ93098 351 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 AMNQ9BXJ7 453 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 KAT14Q9H8E8 782 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.15□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TREHO43280 583 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKIO75912 1065 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS2P05162 132 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FGRP09769 529 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SNHG28P0DPA3 235 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP4P98171 946 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM26DQ5JW98 314 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKHQ86XP1 1220 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 POF1BQ8WVV4 589 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ASIC4Q96FT7 647 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01565O15544 149 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K13O43283 966 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC8P31273 242 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ALX1Q15699 326 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ODR4Q5SWX8 454 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 IER5Q5VY09 327 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CES5AQ6NT32 575 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TICAM2Q86XR7 235 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC1BQ9P126 229 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SQORQ9Y6N5 450 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.13□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP3O14638 875 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2MP0CAP2 368 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GHRP10912 638 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL7BQ6UX53 244 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ADSSL1Q8N142 457 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA1Q8ND90 353 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD4Q9NVD3 440 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.12□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYM6O95789 1325 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB1P05556 798 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.11□□□□□ -0.95
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B4P51659 736 aa9.11□□□□□ -0.95
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