RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 RSPH3Q86UC2 560 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TBCKQ8TEA7 893 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KIFAP3Q92845 792 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 EMBQ6PCB8 327 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SEC24CP53992 1094 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 GPSM2P81274 684 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SLC15A2Q16348 729 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 GUCY2CP25092 1073 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 NR2F2P24468 414 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ATP2A1O14983 1001 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CLIC2O15247 247 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ALS2CLQ60I27 953 aa14.59□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TBK1Q9UHD2 729 aa14.59□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.59□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
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HPS3-201ENST00000296051 DDAH1O94760 285 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 RASA3Q14644 834 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 MESDQ14696 234 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SEPT2Q15019 361 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KCNB2Q92953 911 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KLHL29Q96CT2 875 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.58□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 MEIS1O00470 390 aa14.58□□□□□ -0.08
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