RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 PALMO75781 387 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 USH1GQ495M9 461 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MTRQ99707 1265 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.86□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC189A1A4V9 331 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RASSF9O75901 435 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SP4Q02446 784 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ESR2Q92731 530 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 NOD2Q9HC29 1040 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PQC6 194 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC53A6NM62 1247 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 HLA-DOAP06340 250 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 EPS15P42566 896 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CRKP46108 304 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SP8Q8IXZ3 490 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 IQCKQ8N0W5 287 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ADSSL1Q8N142 457 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MTMR8Q96EF0 704 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 LAMA4Q16363 1823 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RAD51CO43502 376 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 UPP2O95045 317 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 FECHP22830 423 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 DYMQ7RTS9 669 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC45Q96CN5 670 aa11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 KCTD1Q719H9 257 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RNF217Q8TC41 542 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 DIAPH2O60879 1101 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 EGFRP00533 1210 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 FCER1AP12319 257 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CXCL9Q07325 125 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MICALL2Q8IY33 904 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SYT17Q9BSW7 474 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 TLR10Q9BXR5 811 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 BICDL2A1A5D9 508 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 UBE3CQ15386 1083 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 MGARPQ8TDB4 240 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 RAPGEF5Q92565 580 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 P2RX5Q93086 422 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CAVIN3Q969G5 261 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 THAP9Q9H5L6 903 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.84□□□□□ -0.51
CNGA3-201ENST00000272602 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 PPP2R2AP63151 447 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 WHAMMQ8TF30 809 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 EPHB6O15197 1021 aa11.83□□□□□ -0.52
CNGA3-201ENST00000272602 HSD17B3P37058 310 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms