RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ANO3Q9BYT9 981 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CALB1P05937 261 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ARL4AP40617 200 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 USP11P51784 963 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 RFX6Q8HWS3 928 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 NBPF3Q9H094 633 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CASP14P31944 242 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 RBL2Q08999 1139 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 HOMEZQ8IX15 550 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PPCSQ9HAB8 311 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PQC6 194 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5HO75947 161 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM15Q9C019 465 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 LONRF3Q496Y0 759 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 METTL13Q8N6R0 699 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 RAD54LQ92698 747 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PIGSQ96S52 555 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-201ENST00000261266 KCNB1Q14721 858 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 INHBAP08476 426 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 DRC3Q9H069 523 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 UTYO14607 1347 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 OSBP2Q969R2 916 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF653Q96CK0 615 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PROSER3Q2NL68 480 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ATG16L1Q676U5 607 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 EXOC4Q96A65 974 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PSMD1Q99460 953 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 TBX3O15119 743 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MFAP3LO75121 409 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 HIP1RO75146 1068 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 SBK1Q52WX2 424 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 SP8Q8IXZ3 490 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 RASEFQ8IZ41 740 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 GPATCH11Q8N954 259 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 CEP120Q8N960 986 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 SASH1O94885 1247 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PIGBQ92521 554 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 LGALS16A8MUM7 142 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 TTC4O95801 387 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MXI1P50539 228 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 STX1BP61266 288 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 DEUP1Q05D60 604 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PPP2R5DQ14738 602 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 RPS6KA2Q15349 733 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 CLIC6Q96NY7 704 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MMS19Q96T76 1030 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 NDST4Q9H3R1 872 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 CPDO75976 1380 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 PAMP19021 973 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 RILPQ96NA2 401 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms