RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 EPHB1P54762 984 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TMEM259Q4ZIN3 620 aa17.29■□□□□ 0.36
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CTIF-201ENST00000256413 PYGBP11216 843 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ECE1P42892 770 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FUT8Q9BYC5 575 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.29■□□□□ 0.36
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CTIF-201ENST00000256413 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.28■□□□□ 0.36
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CTIF-201ENST00000256413 SCYL2Q6P3W7 929 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NEURL1BA8MQ27 555 aa17.27■□□□□ 0.36
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CTIF-201ENST00000256413 KRT75O95678 551 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 BBS9Q3SYG4 887 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 FSCBQ5H9T9 825 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RAPH1Q70E73 1250 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.26■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 PGM1P36871 562 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PTK2Q05397 1052 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 DCAF5Q96JK2 942 aa17.26■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 CA8P35219 290 aa17.26■□□□□ 0.35
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CTIF-201ENST00000256413 RFX6Q8HWS3 928 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CCDC159P0C7I6 412 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 CHN1P15882 459 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 RFX8Q6ZV50 586 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 FAM96AQ9H5X1 160 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 PDP2Q9P2J9 529 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-201ENST00000256413 SNX12Q9UMY4 172 aa17.26■□□□□ 0.35
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