RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 COG5Q9UP83 839 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ERVK-21P61565 698 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM17P78536 824 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR1Q13613 665 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 KRT40Q6A162 431 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 APOA5Q6Q788 366 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SPRED2Q7Z698 418 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 JADE2Q9NQC1 790 aa24.14■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 LINC01553A4QN01 128 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 LPXNO60711 386 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 CTSHP09668 335 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 KRT32Q14532 448 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB43O43298 467 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 RTN1Q16799 776 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 FAM26DQ5JW98 314 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 APBB2Q92870 758 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 BMP1P13497 986 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 NAPAP54920 295 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TFF2Q03403 129 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 RPAINQ86UA6 219 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GLG1Q92896 1179 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 NCOR1O75376 2440 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TRANK1O15050 2925 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 CDC45O75419 566 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 PPFIA1Q13136 1202 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 RSPH3Q86UC2 560 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SKAP1Q86WV1 359 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 RASEFQ8IZ41 740 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TOP1MTQ969P6 601 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 HLA-CQ95604 372 aa24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 FUT2Q10981 343 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 GRIK4Q16099 956 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.08■■□□□ 1.45
NEDD8-201ENST00000250495 SMCO2A6NFE2 343 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 CHRNA1P02708 482 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 MARK3P27448 753 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 ADCY7P51828 1080 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 RCAN1P53805 252 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 FGD1P98174 961 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 SAMD11Q96NU1 681 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 YME1L1Q96TA2 773 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 SDF4Q9BRK5 362 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 AZI2Q9H6S1 392 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.07■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 UPP2O95045 317 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 KCNQ1P51787 676 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 CEP55Q53EZ4 464 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.06■■□□□ 1.44
NEDD8-201ENST00000250495 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.06■■□□□ 1.44
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