RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP6P22004 513 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 COL20A1Q9P218 1284 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB11O95342 1321 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R3AQ06190 1150 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA20Q8TB22 786 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEB2H3BUK9 544 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGCRP04035 888 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA1Q92805 767 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A6Q9BXS9 759 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGAP3Q9NP61 516 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 GPS2Q13227 327 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TXLNBQ8N3L3 684 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCGO15287 622 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CFBP00751 764 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC175P0C221 793 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NR1I3Q14994 352 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PDILTQ8N807 584 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R5BQ15173 497 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV1Q8NER1 839 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PFASO15067 1338 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTH6 734 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DEXIO95424 95 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD3Q15059 726 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PKN1Q16512 942 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TINF2Q9BSI4 451 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ST7Q9NRC1 585 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMA2Q9UL42 364 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC151A5D8V7 595 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SHISA4Q96DD7 197 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL5P13501 91 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC51Q96ER9 411 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR24Q96S15 920 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TXLNAP40222 546 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR1Q96RJ0 339 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS3O15072 1205 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP15O95972 392 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L6PQ6QN14 398 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPYL1Q9H0U9 437 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF208Q9H0X6 261 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SERTAD1Q9UHV2 236 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD18B2RXH4 712 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP112Q8N8E3 955 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEFA5A3E0 1075 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN2AP68543 259 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA1Q5VX52 437 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN15O75808 1086 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBBP07437 444 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B4P51659 736 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX10P56693 466 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMCX2Q7L311 632 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PPFIBP1Q86W92 1011 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 STXBP3O00186 592 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 EEPD1Q7L9B9 569 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 MCF2L2Q86YR7 1114 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIS2O14770 477 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CYBAP13498 195 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SCG2P13521 617 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 XBP1P17861 261 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms