RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 GTF2IP78347 998 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC125Q86Z20 511 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PNMA2Q9UL42 364 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 LRRN2O75325 713 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CDC27P30260 824 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ACCSQ96QU6 501 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 AZI2Q9H6S1 392 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PALLDQ8WX93 1383 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NR1H3Q13133 447 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SNX1Q13596 522 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NEDD4P46934 1319 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ALDH1B1P30837 517 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SIK1P57059 783 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NLRP7Q8WX94 980 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NACC1Q96RE7 527 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 KLC4Q9NSK0 619 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SNX12Q9UMY4 172 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ERBB3P21860 1342 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SGK1O00141 431 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ICA1Q05084 483 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TTLL1O95922 423 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 MT-ND3P03897 115 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CA4P22748 312 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 KCNB1Q14721 858 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC93Q567U6 631 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TTC16Q8NEE8 873 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TSC22D3Q99576 134 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CLIC2O15247 247 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 RCN2Q14257 317 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SPARCL1Q14515 664 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PPP2R5DQ14738 602 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TC2NQ8N9U0 490 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 OXER1Q8TDS5 423 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PFDN1O60925 122 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NR1I3Q14994 352 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GDAP1Q8TB36 358 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TBK1Q9UHD2 729 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 RNF34Q969K3 372 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SNX24Q9Y343 169 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CAV1Q03135 178 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ADCY1Q08828 1119 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 FAM187AA6NFU0 413 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 FOXN1O15353 648 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PICK1Q9NRD5 415 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 PARVGQ9HBI0 331 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 STOML1Q9UBI4 398 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GNPTABQ3T906 1256 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 EPN3Q9H201 632 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC3O15438 1527 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 GLI2P10070 1586 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 TNNC2P02585 160 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 MXI1P50539 228 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA13-201ENST00000222753 POLE2P56282 527 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms