RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 GIT2Q14161 759 aa26.58■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.58■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.58■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.58■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGB5P18084 799 aa26.57■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NIPA1Q7RTP0 329 aa26.57■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 REEP2Q9BRK0 252 aa26.57■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.57■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SLITRK3O94933 977 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MUTP22033 750 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NSMFQ6X4W1 530 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 COG2Q14746 738 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 IL31RAQ8NI17 732 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF146Q9NTX7 359 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.56■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHA7Q15375 998 aa26.55■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.55■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 WNK4Q96J92 1243 aa26.55■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TUBB4AP04350 444 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 DSG3P32926 999 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SULF1Q8IWU6 871 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF18AQ8NI77 898 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TAAR1Q96RJ0 339 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAF5O00463 557 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 OAZ1P54368 228 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TKFCQ3LXA3 575 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NACC1Q96RE7 527 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RMDN3Q96TC7 470 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT9P35527 623 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR1Q13613 665 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 JADE2Q9NQC1 790 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RLFQ13129 1914 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 PGM5Q15124 567 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MIIPQ5JXC2 388 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SFR1Q86XK3 245 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NEK9Q8TD19 979 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP58Q9BVL2 599 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.53■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MAN2A1Q16706 1144 aa26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 RIPK3Q9Y572 518 aa26.52■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.51■■□□□ 1.84
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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RPUSD1-201ENST00000007264 VWA3BQ502W6 1294 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 TMTC1Q8IUR5 882 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 SYT17Q9BSW7 474 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 PXMP2Q9NR77 195 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC175P0C221 793 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 RETREG2Q8NC44 543 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 REPS2Q8NFH8 660 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 LXNQ9BS40 222 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.51■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC26A0AVF1 554 aa26.5■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 GAP43P17677 238 aa26.5■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K9P80192 1104 aa26.5■■□□□ 1.83
RPUSD1-201ENST00000007264 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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