RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 OSBP2Q969R2 916 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 ARMC5Q96C12 935 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 TMEM169Q96HH4 297 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 USP40Q9NVE5 1235 aa6.06□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 H7BY64 318 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 PRODHO43272 600 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 ITGB3P05106 788 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 HTRA3P83110 453 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 RBL2Q08999 1139 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CPZQ66K79 652 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SEC14L1Q92503 715 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CDIP1Q9H305 208 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.05□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 PDPK1O15530 556 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 RASGRF1Q13972 1273 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 VWA3BQ502W6 1294 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SPATC1Q76KD6 591 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 MIB1Q86YT6 1006 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 MRIQ9BWK5 157 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 GPR27Q9NS67 375 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 MAP3K1Q13233 1512 aa6.04□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 IQGAP2Q13576 1575 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 MSCO60682 206 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SERINC3Q13530 473 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 NTRK3Q16288 839 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 NSMFQ6X4W1 530 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 LIPIQ6XZB0 460 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 USP53Q70EK8 1073 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 NOX5Q96PH1 765 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CLDND1Q9NY35 253 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.03□□□□□ -1.44
CASC19-241ENST00000641582 ADCY3O60266 1144 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SLPIP03973 132 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 C8BP07358 591 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 DCAF4Q8WV16 495 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SPATA25Q9BR10 227 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.02□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 TADA3O75528 432 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 MTERF2Q49AM1 385 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 EMC4Q5J8M3 183 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SAMD9Q5K651 1589 aa6.01□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 A0A1B0GTL3 188 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 BLACEA4D250 179 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 SH3D21A4FU49 640 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 C6P13671 934 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 ZNF20P17024 532 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 GDF5P43026 501 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 CHRNA2Q15822 529 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 LBX2Q6XYB7 198 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 FAM126BQ8IXS8 530 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 FAM26EQ8N5C1 309 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 LINC00482Q8N8I6 264 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 DDX11Q96FC9 970 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 PFDN2Q9UHV9 154 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 DISP1Q96F81 1524 aa6□□□□□ -1.45
CASC19-241ENST00000641582 CEP170Q5SW79 1584 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms