RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACTN1	P12814	892 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR20	Q99678	358 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP26	Q9BXU7	913 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ITGB5	P18084	799 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTMR1	Q13613	665 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	PGBD1	Q96JS3	809 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	MSRA	Q9UJ68	235 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	SELP	P16109	830 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	PBX2	P40425	430 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	PBX4	Q9BYU1	374 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTK7	Q13308	1070 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	RUFY3	Q7L099	469 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP9A	O75110	1047 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCG2	P13521	617 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAB30	Q15771	203 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXL16	Q8N461	479 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		33.17	■■■□□ 2.9
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SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM260	Q9NX78	707 aa		33.17	■■■□□ 2.9
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SEMA3B-215	ENST00000621029	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM50	Q86XT4	487 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYLIP	Q8WY64	445 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHKB	Q93100	1093 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANO3	Q9BYT9	981 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF576	Q9H609	170 aa		33.16	■■■□□ 2.9
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SEMA3B-215	ENST00000621029	CKB	P12277	381 aa		33.15	■■■□□ 2.9
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SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF76	P36508	570 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAFG	O15525	162 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	AP3B2	Q13367	1082 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	HIC1	Q14526	733 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	C6orf50	Q9HD87	102 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	RABGGTB	P53611	331 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRIN2C	Q14957	1233 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	NID2	Q14112	1375 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	GNAT1	P11488	350 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOSL2	P15408	326 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	THPO	P40225	353 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	RBL2	Q08999	1139 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	WNT8B	Q93098	351 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SETD4	Q9NVD3	440 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SERINC5	Q86VE9	423 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLG1	Q92896	1179 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SDF4	Q9BRK5	362 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCN5A	Q14524	2016 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	TREH	O43280	583 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	SREBF1	P36956	1147 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	PKN1	Q16512	942 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP55	Q53EZ4	464 aa		33.09	■■■□□ 2.89

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