RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DISP2	A7MBM2	1401 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ATP8B3	O60423	1300 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NUP205	Q92621	2012 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CDC27	P30260	824 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25	3e-6	■■■□□ 18.7
ACACA-231	ENST00000614428	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MAP2K7	O14733	419 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	HIP1R	O75146	1068 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	L1RE1	Q9UN81	338 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PRCP	P42785	496 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	USP11	P51784	963 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NBPF26	B4DH59	902 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FAM107A	O95990	144 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TNFAIP3	P21580	790 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CUL4B	Q13620	913 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	VEZT	Q9HBM0	779 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	EHHADH	Q08426	723 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LGSN	Q5TDP6	509 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FBXO41	Q8TF61	875 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	STMN2	Q93045	179 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TEKT1	Q969V4	418 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TTC25	Q96NG3	672 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ADRA2B	P18089	450 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	RASSF7	Q02833	373 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	BTG4	Q9NY30	223 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SLC18A3	Q16572	532 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	STAMBP	O95630	424 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CHRNA3	P32297	505 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TXK	P42681	527 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PDE4C	Q08493	712 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	STRN3	Q13033	797 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	HOOK2	Q96ED9	719 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25	8e-9	■■■■□ 23.8
ACACA-231	ENST00000614428	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	GCNT3	O95395	438 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TNS2	Q63HR2	1409 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PRDM1	O75626	825 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF365	Q70YC5	407 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	AMN	Q9BXJ7	453 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM206	Q9H813	350 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	USP40	Q9NVE5	1235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428		I3L4J1	428 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SIK1	P57059	783 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25	1e-6	■■■■□ 22.5
ACACA-231	ENST00000614428	DR1	Q01658	176 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	NPEPPS	P55786	919 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	IL9R	Q01113	521 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF131	P52739	623 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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