RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 TEKT1Q969V4 418 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 EHD4Q9H223 541 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CEP72Q9P209 647 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 TLR2O60603 784 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SLC1A4P43007 532 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ITIH3Q06033 890 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ZSCAN26Q16670 478 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CEP63Q96MT8 703 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ANO3Q9BYT9 981 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CYP11B2P19099 503 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 GPBP1Q86WP2 473 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 STAT3P40763 770 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC17Q96LX7 622 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 FAM196BA6NMK8 535 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 USP11P51784 963 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 RASSF7Q02833 373 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 MED24O75448 989 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CYP3A7P24462 503 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CXCR5P32302 372 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 MBOAT7Q96N66 472 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 PSMB7Q99436 277 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMM44-210ENST00000599939 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 NCK2O43639 380 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 RAD21O60216 631 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 RNF40O75150 1001 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 APBA1Q02410 837 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 TLR10Q9BXR5 811 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.2■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 POTEFA5A3E0 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 MEIS2O14770 477 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 GNA14O95837 355 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 POTEIP0CG38 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 ACTN2P35609 894 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 CACNB3P54284 484 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SLC12A3P55017 1021 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 ARSHQ5FYA8 562 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 POTEGQ6S5H5 508 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SERPING1P05155 500 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 CRKP46108 304 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 DCAF4Q8WV16 495 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 MKL1Q969V6 931 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM44-210ENST00000599939 HINFPQ9BQA5 517 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms