RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 PRPHP41219 470 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 MAGEA1P43355 309 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 GSTO1P78417 241 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CNBD1Q8NA66 436 aa11.79□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 ESYT3A0FGR9 886 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 TRAF5O00463 557 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 LAD1O00515 517 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 AKR1B1P15121 316 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SLC1A4P43007 532 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC181Q5TID7 509 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD1Q719H9 257 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 ANKS1AQ92625 1134 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 AK8Q96MA6 479 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 FAM196BA6NMK8 535 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 TACC1O75410 805 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 LDHCP07864 332 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 GRAPQ13588 217 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 GALNT17Q6IS24 598 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CREG2Q8IUH2 290 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 EDIL3O43854 480 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 PDHBP11177 359 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 FNTAP49354 379 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 IRAK1P51617 712 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 ADCY7P51828 1080 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SNAP25P60880 206 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 GTF2IP78347 998 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SNX12Q9UMY4 172 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.77□□□□□ -0.52
FCHO1-216ENST00000596536 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 E9PMD0 336 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 FTCDO95954 541 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 MYL1P05976 194 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SCNN1DP51172 638 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 KRT79Q5XKE5 535 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 CENPPQ6IPU0 288 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 MTMR8Q96EF0 704 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SAMM50Q9Y512 469 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 MYH10P35580 1976 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 CRYMQ14894 314 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 CUEDC2Q9H467 287 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SH2D4AQ9H788 454 aa11.77□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L15C9J2P7 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L11C9JVI0 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L18D6R9N7 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L22D6RA61 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L19D6RCP7 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L20D6RJB6 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 STAT3P40763 770 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 61.8
FCHO1-216ENST00000596536 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L24Q0WX57 530 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 UNC13DQ70J99 1090 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 RETREG2Q8NC44 543 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SNED1Q8TER0 1413 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 SHTN1A0MZ66 631 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 AGPSO00116 658 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 RHBDL3P58872 404 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 PPP4CP60510 307 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 MAN2A1Q16706 1144 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM58Q8NG06 486 aa11.76□□□□□ -0.53
FCHO1-216ENST00000596536 IFT81Q8WYA0 676 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms