RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.95■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 H3BRB1 525 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 COL9A1P20849 921 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 IKBKEQ14164 716 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 AAK1Q2M2I8 961 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 MYL10Q9BUA6 226 aa24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.94■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 TRIM50Q86XT4 487 aa24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 LY9Q9HBG7 655 aa24.93■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 EMSYQ7Z589 1322 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 KAT6AQ92794 2004 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.92■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 EFCAB14O75071 495 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 RSPH10BP0C881 870 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 ICAM3P32942 547 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 ERVK-21P61565 698 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 METTL7BQ6UX53 244 aa24.92■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 COG5Q9UP83 839 aa24.92■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 HLA-CQ95604 372 aa24.91■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.91■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.91■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 FIBPO43427 364 aa24.89■■□□□ 1.58
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USF2-204ENST00000593708 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.89■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 SETD4Q9NVD3 440 aa24.89■■□□□ 1.58
USF2-204ENST00000593708 MYO7AQ13402 2215 aa24.89■■□□□ 1.57
USF2-204ENST00000593708 DDAH1O94760 285 aa24.88■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 INSL6Q9Y581 213 aa24.87■■□□□ 1.57
USF2-204ENST00000593708 PRC1O43663 620 aa24.86■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.86■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.86■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.84■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.83■■□□□ 1.57
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USF2-204ENST00000593708 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
USF2-204ENST00000593708 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
USF2-204ENST00000593708 KCNA2P16389 499 aa24.82■■□□□ 1.56
USF2-204ENST00000593708 ITGB5P18084 799 aa24.82■■□□□ 1.56
USF2-204ENST00000593708 ARHGAP4P98171 946 aa24.82■■□□□ 1.56
USF2-204ENST00000593708 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.82■■□□□ 1.56
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