RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 HINFPQ9BQA5 517 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 TLR10Q9BXR5 811 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 RIMBP2O15034 1052 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 TLR2O60603 784 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 GNA14O95837 355 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP40Q9NVE5 1235 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SERPING1P05155 500 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 PLA2G4BP0C869 781 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 PAFAH1B1P43034 410 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 CERS5Q8N5B7 392 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 COA1Q9GZY4 146 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP21Q9UK80 565 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 BUB1O43683 1085 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 EHD2Q9NZN4 543 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 POTEB3A0JP26 581 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 POTECB2RU33 542 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 TOM1O60784 492 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 POTEBQ6S5H4 581 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 GPBP1Q86WP2 473 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 TSKSQ9UJT2 592 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 LTBP1Q14766 1721 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 UIMC1Q96RL1 719 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L15C9J2P7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L11C9JVI0 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L18D6R9N7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L22D6RA61 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L19D6RCP7 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L20D6RJB6 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SLC7A5Q01650 507 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L24Q0WX57 530 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 LRRC31Q6UY01 552 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 STIM2Q9P246 746 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 CYP11B2P19099 503 aa22.2■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 SP8Q8IXZ3 490 aa22.2■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.2■■□□□ 1.15
TTC9B-202ENST00000593586 MYH4Q9Y623 1939 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 SLC26A4O43511 780 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 HLA-DOAP06340 250 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 TMC4Q7Z404 712 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 SCNN1DP51172 638 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 USP11P51784 963 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 DDR1Q08345 913 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 SRLQ86TD4 932 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 EPHB4P54760 987 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 APBA1Q02410 837 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 TBC1D5Q92609 795 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 MXD3Q9BW11 206 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 ANO3Q9BYT9 981 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 RNF14Q9UBS8 474 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 CYP3A7P24462 503 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC9B-202ENST00000593586 ADAM9Q13443 819 aa22.18■■□□□ 1.14
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