RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MAF1Q9H063 256 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMC6P62333 389 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PKN1Q16512 942 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF536O15090 1300 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCB11O95342 1321 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH6P13533 1939 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 GJB2P29033 226 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 BARHL2Q9NY43 387 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCP20941 246 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 RFC2P35250 354 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG1Q9BT22 464 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 Q9Y3F1 56 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTN2Q02246 1040 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL18Q96ME1 805 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 ESYT2A0FGR8 921 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2C9P11712 490 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SMPD1P17405 629 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SNAP25P60880 206 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 WDFY4Q6ZS81 3184 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN5AQ14524 2016 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB14A6NK59 587 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 PPFIA3O75145 1194 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM29Q14134 588 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 IQSEC1Q6DN90 963 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 STXBP3O00186 592 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 NAPAP54920 295 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GALNT17Q6IS24 598 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGS1P23219 599 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 USH1GQ495M9 461 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRED2Q7Z698 418 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 MCF2L2Q86YR7 1114 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 C8orf76Q96K31 380 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 ALAS1P13196 640 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 CALML3P27482 149 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.911e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-214ENST00000592483 ACAD9Q9H845 621 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF146Q9NTX7 359 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 SOWAHBA6NEL2 793 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 BAIAP3O94812 1187 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GNA11P29992 359 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 BICD2Q8TD16 824 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf50Q9HD87 102 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 PITPNM1O00562 1244 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCF3P0C7M6 154 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNA5P22460 613 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GHRHRQ02643 423 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 MCTP2Q6DN12 878 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 RETREG2Q8NC44 543 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 AIFM3Q96NN9 605 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 PDGFCQ9NRA1 345 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEB3A0JP26 581 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 DCXO43602 365 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP5P59047 1200 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEBQ6S5H4 581 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 CUL5Q93034 780 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-214ENST00000592483 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.95■■□□□ 1.9
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