RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, humanhuman

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRN-215ENST00000589536 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 PTPRSQ13332 1948 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 APOA5Q6Q788 366 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 SERINC5Q86VE9 423 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 RASEFQ8IZ41 740 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.14■■■□□ 2.1
GRN-215ENST00000589536 CDC45O75419 566 aa28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 WDR5P61964 334 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 MBTPS1Q14703 1052 aa28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TCTN1Q2MV58 587 aa28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 USP26Q9BXU7 913 aa28.13■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 IGFBP4P22692 258 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.12■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ARHGEF15O94989 841 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 KCNJ6P48051 423 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 UBE2SQ16763 222 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 NLRX1Q86UT6 975 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TRIM50Q86XT4 487 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 PPM1EQ8WY54 764 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 GPRASP2Q96D09 838 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.11■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ITGB5P18084 799 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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GRN-215ENST00000589536 TRANK1O15050 2925 aa28.1■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 KCNA2P16389 499 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 DEFB103AP81534 67 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TAP1Q03518 808 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 FUT2Q10981 343 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 REV3LO60673 3130 aa28.09■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 KIF28PB7ZC32 967 aa28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TREHO43280 583 aa28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 ATP9AO75110 1047 aa28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 THPOP40225 353 aa28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GRN-215ENST00000589536 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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GRN-215ENST00000589536 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.08■■■□□ 2.09
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GRN-215ENST00000589536 ZBTB43O43298 467 aa28.07■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 SP4Q02446 784 aa28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 KRT32Q14532 448 aa28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 RTN1Q16799 776 aa28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.07■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 EMSYQ7Z589 1322 aa28.07■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 RSPH10BP0C881 870 aa28.06■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 CERS4Q9HA82 394 aa28.06■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 SETD4Q9NVD3 440 aa28.06■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 RFXAPO00287 272 aa28.05■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 ADAM17P78536 824 aa28.05■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 MTMR1Q13613 665 aa28.05■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 IKBKEQ14164 716 aa28.05■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.04■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.04■■■□□ 2.08
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GRN-215ENST00000589536 JADE2Q9NQC1 790 aa28.04■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 THEGQ9P2T0 379 aa28.04■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.03■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 GNAT1P11488 350 aa28.03■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 RCAN1P53805 252 aa28.03■■■□□ 2.08
GRN-215ENST00000589536 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.03■■■□□ 2.08
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