RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TBCKQ8TEA7 893 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FGD4Q96M96 766 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP19Q99542 508 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ACAD9Q9H845 621 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2A1O14983 1001 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CA12O43570 354 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC37A4O43826 429 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR2O60603 784 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GNA11P29992 359 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B4P51659 736 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 OAZ1P54368 228 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN1Q05586 938 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NNTQ13423 1086 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL14Q16627 93 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 LETM2Q2VYF4 491 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC38Q5R3I4 469 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR142Q7Z601 462 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MB21D1Q8N884 522 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRQQ9UN88 632 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAMO43451 1857 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RPTORQ8N122 1335 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM86B1E9PN63 330 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FDX1P10109 184 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ADORA2AP29274 412 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 IRS1P35568 1242 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 INHBEP58166 350 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP4P98171 946 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD2Q14681 263 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PGM5Q15124 567 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 IL17AQ16552 155 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TKFCQ3LXA3 575 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SPECC1Q5M775 1068 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO1Q5XXA6 986 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK8Q86SG6 692 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST13Q8NET6 341 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RMDN3Q96TC7 470 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PP2D1A8MPX8 630 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3CDO00329 1044 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM23O75077 832 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A27O95847 323 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ARP10275 920 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 FCER1AP12319 257 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMP2P16035 220 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2B6P20813 491 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP2K2P36507 400 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF76P36508 570 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SREBF1P36956 1147 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3BP2P78314 561 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNA1P78396 465 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 STK38Q15208 465 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPAQ15257 358 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR16Q569H4 304 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.85□□□□□ -1.31
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