RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.06■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TAP1Q03518 808 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 MBTPS1Q14703 1052 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TCTN1Q2MV58 587 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 FANCBQ8NB91 859 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 GPR20Q99678 358 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 THEGQ9P2T0 379 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 VCANP13611 3396 aa21.05■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 EFCAB14O75071 495 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF15O94989 841 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 NLRX1Q86UT6 975 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TTC28Q96AY4 2481 aa21.04■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 DEFB103AP81534 67 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 RNF20Q5VTR2 975 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TRANK1O15050 2925 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 EMSYQ7Z589 1322 aa21.03■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 EPOPA6NHQ4 379 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TLL1O43897 1013 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 LGR5O75473 907 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 IKBKEQ14164 716 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 GPRASP2Q96D09 838 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 NEK1Q96PY6 1258 aa21.02■□□□□ 0.96
CTIF-206ENST00000588345 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RFXAPO00287 272 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TREHO43280 583 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CAND2O75155 1236 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 GJB5O95377 273 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ADAM17P78536 824 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 APOA5Q6Q788 366 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 SKAP1Q86WV1 359 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MICU3Q86XE3 530 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CDHR1Q96JP9 859 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CERS4Q9HA82 394 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.01■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RSPH10B2B2RC85 870 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RSPH10BP0C881 870 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 KCNA2P16389 499 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ITGB5P18084 799 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 THPOP40225 353 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TRIM50Q86XT4 487 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CCDC82Q8N4S0 544 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ASB2Q96Q27 587 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 LCHNA4D1U4 455 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ATP9AO75110 1047 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 GNAT1P11488 350 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RAD9AQ99638 391 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 SETD4Q9NVD3 440 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 KAT6AQ92794 2004 aa20.99■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 UBE2SQ16763 222 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 SPRED2Q7Z698 418 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 RASEFQ8IZ41 740 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.98■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 MAFGO15525 162 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 CDC45O75419 566 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 FUT2Q10981 343 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 GRB10Q13322 594 aa20.97■□□□□ 0.95
CTIF-206ENST00000588345 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms