RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577435.5

GGA3-203, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-203ENST00000577435 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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GGA3-203ENST00000577435 ADAMTS3O15072 1205 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 PPFIA3O75145 1194 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 CDKL5O76039 1030 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 ARHGAP4P98171 946 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 20.8
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GGA3-203ENST00000577435 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 PGBD1Q96JS3 809 aa15.95■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 HIPK3Q9H422 1215 aa15.95■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 GALNT17Q6IS24 598 aa15.94■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.94■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 STK36Q9NRP7 1315 aa15.94■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 CYP2C18P33260 490 aa15.93■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 C7orf31Q8N865 590 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.93■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.93■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 SLC34A2O95436 690 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 CTDNEP1O95476 244 aa15.92■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 ARP10275 920 aa15.92■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.92■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 M0R2N6 131 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.91■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 IL23AQ9NPF7 189 aa15.91■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 NOD1Q9Y239 953 aa15.91■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 EDIL3O43854 480 aa15.9■□□□□ 0.14
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GGA3-203ENST00000577435 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 BLIDQ8IZY5 108 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 RETREG2Q8NC44 543 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 IL27Q8NEV9 243 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 AIFM3Q96NN9 605 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 18.9
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GGA3-203ENST00000577435 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
GGA3-203ENST00000577435 TET1Q8NFU7 2136 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 ATG7O95352 703 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 LARGE1O95461 756 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 XBP1P17861 261 aa15.89■□□□□ 0.13
GGA3-203ENST00000577435 RFC2P35250 354 aa15.89■□□□□ 0.13
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