RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 B2RBV5 119 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 ADAM23O75077 832 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 GJB6O95452 261 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 ANXA1P04083 346 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 SERPINB2P05120 415 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 HOXB7P09629 217 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 ITGB7P26010 798 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 CHRNA5P30532 468 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 TGFB2P61812 414 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 SERINC3Q13530 473 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 MSMPQ1L6U9 139 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.15□□□□□ -1.42
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PRPF8-211ENST00000574728 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 TSPYL6Q8N831 410 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 GBP3Q9H0R5 595 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.15□□□□□ -1.42
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PRPF8-211ENST00000574728 PRR13Q9NZ81 148 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF8-211ENST00000574728 BCORQ6W2J9 1755 aa6.15□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ATP10DQ9P241 1426 aa6.15□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 H3BS24 57 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 IGSF3O75054 1194 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ITGA4P13612 1032 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 CD247P20963 164 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 PRELPP51888 382 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ADCY9O60503 1353 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 SHOXO15266 292 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 CBFA2T2O43439 604 aa6.13□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 VAV3Q9UKW4 847 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ABCC12Q96J65 1359 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SNED1Q8TER0 1413 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 CCER2I3L3R5 266 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SIGLEC6O43699 453 aa6.12□□□□□ -1.43
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PRPF8-211ENST00000574728 NTSR2O95665 410 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SRFP11831 508 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 MYL6BP14649 208 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SSTR4P31391 388 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 PRKCQQ04759 706 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 GPR162Q16538 588 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 AOC3Q16853 763 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SUSD4Q5VX71 490 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 COPS6Q7L5N1 327 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 WDR63Q8IWG1 891 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 ASB11Q8WXH4 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF8-211ENST00000574728 UBE2FQ969M7 185 aa6.12□□□□□ -1.43
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