RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 RUNDC1Q96C34 613 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 GPATCH3Q96I76 525 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 USP24Q9UPU5 2620 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FRYLO94915 3013 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TNKSO95271 1327 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1B0GUL7 405 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ADH1CP00326 375 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NR3C2P08235 984 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 VCAM1P19320 739 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CCL23P55773 120 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NKX3-2P78367 333 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 JAG1P78504 1218 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CLN3Q13286 438 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TTLL4Q14679 1199 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 BEND3Q5T5X7 828 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MCTP2Q6DN12 878 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TTC16Q8NEE8 873 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.3□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MYADML2A6NDP7 307 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 RNF223E7ERA6 249 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 H0Y858 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 ADH1AP07327 375 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ADSSL1Q8N142 457 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TSPYL6Q8N831 410 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 SIL1Q9H173 461 aa6.29□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DNAJC18Q9H819 358 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PTPROQ16827 1216 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SPRED2Q7Z698 418 aa6.28□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.28□□□□□ -1.4
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