RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 ARMCX2Q7L311 632 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 USP6NLQ92738 828 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CALML4Q96GE6 196 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 TIGD1Q96MW7 591 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 SDF4Q9BRK5 362 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 NFASCO94856 1347 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CDC25AP30304 524 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 VTA1Q9NP79 307 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 TGFB3P10600 412 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 KCNA2P16389 499 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 KRT76Q01546 638 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 PDILTQ8N807 584 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 IQUBQ8NA54 791 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 APBA2Q99767 749 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 DISC1Q9NRI5 854 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 GJD2Q9UKL4 321 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 ATP9AO75110 1047 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 DHX58Q96C10 678 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 TRIM47Q96LD4 638 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 TINF2Q9BSI4 451 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 PANK2Q9BZ23 570 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 A0A087X0B3 334 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 GPR25O00155 361 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CTAGE5O15320 804 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CHMP2AO43633 222 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CYP2B6P20813 491 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CTGFP29279 349 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 STAT6P42226 847 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 NEDD9Q14511 834 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 EPHA7Q15375 998 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 KANK3Q6NY19 840 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CNNM3Q8NE01 707 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 NEK9Q8TD19 979 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 TNMDQ9H2S6 317 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 SFNP31947 248 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 JAK3P52333 1124 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 IRF5Q13568 498 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 LONRF3Q496Y0 759 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 HYIQ5T013 277 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 RDM1Q8NG50 284 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 SCFD2Q8WU76 684 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 CUEDC2Q9H467 287 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 WDR81Q562E7 1941 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 WDR64B1ANS9 1081 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 EML1O00423 815 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-202ENST00000570641 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms