RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CEP63Q96MT8 703 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ZMYND15Q9H091 742 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 POTEB2H3BUK9 544 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D8O95759 1140 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE8P0CG41 777 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ERCC3P19447 782 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CIITAP33076 1130 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CYP27A1Q02318 531 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ERMNQ8TAM6 284 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CCDC42Q96M95 316 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ZNF263O14978 683 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 VAV2P52735 878 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 BRD3Q15059 726 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 FAM20AQ96MK3 541 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.67■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 C21orf2O43822 256 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 BAP1Q92560 729 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ST7Q9NRC1 585 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CCDC151A5D8V7 595 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 LRRC53A6NM62 1247 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ENC1O14682 589 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 RPA1P27694 616 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KCNMA1Q12791 1236 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SLC15A2Q16348 729 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 NEK11Q8NG66 645 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.66■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 MSH4O15457 936 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SASH3O75995 380 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KIF20AO95235 890 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SPDYE6P0CI01 402 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ECE1P42892 770 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PSMC6P62333 389 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SPA17Q15506 151 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 RRAGAQ7L523 313 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 RAB21Q9UL25 225 aa25.65■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PDXDC1Q6P996 788 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PNKPQ96T60 521 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 STK24Q9Y6E0 443 aa25.64■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CLRN2A0PK11 232 aa25.64■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 MEIS1O00470 390 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 GNA14O95837 355 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CYP3A4P08684 503 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 STAT2P52630 851 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
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EHD4-202ENST00000569223 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 VAV3Q9UKW4 847 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 DNM3Q9UQ16 869 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.64■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 LCA5LO95447 670 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 KIF11P52732 1056 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 KIF5AQ12840 1032 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 GIT2Q14161 759 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ACER1Q8TDN7 264 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.63■■□□□ 1.69
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