RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 SLC9A7Q96T83 725 aa22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 USP26Q9BXU7 913 aa22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 MYO9BQ13459 2157 aa22.26■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TRANK1O15050 2925 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 CDC45O75419 566 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 BAIAP3O94812 1187 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ITGB5P18084 799 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 CUL5Q93034 780 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ATP9AO75110 1047 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ARHGEF15O94989 841 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ADAM17P78536 824 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 MICU3Q86XE3 530 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.24■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 CA3P07451 260 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 KCNA2P16389 499 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 UBE2SQ16763 222 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 GPRASP2Q96D09 838 aa22.23■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 REV3LO60673 3130 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 GBF1Q92538 1859 aa22.22■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TTC28Q96AY4 2481 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TREHO43280 583 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TAP1Q03518 808 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 NLRX1Q86UT6 975 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 TRIM50Q86XT4 487 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
E2F4-209ENST00000567228 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 CDC27P30260 824 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 DEFB103AP81534 67 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 KRT32Q14532 448 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 JADE2Q9NQC1 790 aa22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 EPOPA6NHQ4 379 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 MAFGO15525 162 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 ZBTB43O43298 467 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RCAN1P53805 252 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RTN1Q16799 776 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 SETD4Q9NVD3 440 aa22.19■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RFXAPO00287 272 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 RSPH10BP0C881 870 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 HSPA4P34932 840 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 THPOP40225 353 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 FBXL16Q8N461 479 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 CDHR1Q96JP9 859 aa22.18■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 STXBP3O00186 592 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 LGR5O75473 907 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 CPA1P15085 419 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 IGFBP4P22692 258 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 SPRED2Q7Z698 418 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.17■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 EMSYQ7Z589 1322 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 LCHNA4D1U4 455 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 KIF28PB7ZC32 967 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 CAND2O75155 1236 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 GJB5O95377 273 aa22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
E2F4-209ENST00000567228 KCNJ6P48051 423 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms