RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 SORBS3O60504 671 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 RTP1P59025 263 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NR5A1Q13285 461 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 INF2Q27J81 1249 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR16Q569H4 304 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SDF4Q9BRK5 362 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NFASCO94856 1347 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP9AO75110 1047 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PPFIA4O75335 1185 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ARP10275 920 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GUCY1B3Q02153 619 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CUL4AQ13619 759 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NEK8Q86SG6 692 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFRSF25Q93038 417 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 BTBD18B2RXH4 712 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GJB2P29033 226 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SP4Q02446 784 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGA7Q13683 1181 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM60Q495X7 471 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SNX21Q969T3 373 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 LENG9Q96B70 501 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ARVCFO00192 962 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 F2P00734 622 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF286BP0CG31 522 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 HSCBQ8IWL3 235 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR20Q99678 358 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TDP2O95551 362 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP3A7P24462 503 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMC6P62333 389 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 LETM2Q2VYF4 491 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 Q4G0T1 1027 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM205CA6NFA0 338 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 EDIL3O43854 480 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 LGALS2P05162 132 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TOX2Q96NM4 488 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-208ENST00000558954 GRIN2DO15399 1336 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK7P50613 346 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TLE2Q04725 743 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 KAT2BQ92831 832 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MBOAT7Q96N66 472 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MSH4O15457 936 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP4BP1P59074 171 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD10Q14728 455 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 EMSYQ7Z589 1322 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 H3BQV1 296 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 H3BRB1 525 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC37A4O43826 429 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms