RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 HGSNATQ68CP4 663 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 POTEGQ6S5H5 508 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM58Q8NG06 486 aa22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOL4O94818 638 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGEA1P43355 309 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 BUB1O43683 1085 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TLR2O60603 784 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TACC1O75410 805 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 LCA5LO95447 670 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLFN13Q68D06 897 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQCDQ96DY2 449 aa22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEIS1O00470 390 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEIS2O14770 477 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBBP07437 444 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP11B2P19099 503 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMC6P62333 389 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEPT2Q15019 361 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARSHQ5FYA8 562 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 HYIQ5T013 277 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLD4Q9HCU8 107 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 GDF11O95390 407 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 USH1GQ495M9 461 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 EXOC4Q96A65 974 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.09■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASP5P51878 434 aa22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARID5AQ03989 594 aa22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRR16Q569H4 304 aa22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.08■■□□□ 1.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIPA1L1O43166 1804 aa22.08■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPR1P16066 1061 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC12A3P55017 1021 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC17Q96LX7 622 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 EHD4Q9H223 541 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP4P98171 946 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC7A5Q01650 507 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.06■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNA2P51530 1060 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAM9Q13443 819 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP72Q9P209 647 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM86B1E9PN63 330 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP11P51784 963 aa22.05■■□□□ 1.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAG1P78504 1218 aa22.05■■□□□ 1.12
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