RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-215ENST00000557261 M0R2C6 588 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RGS13O14921 159 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 OPA1O60313 960 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 HMMRO75330 724 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GDF11O95390 407 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 STARD3NLO95772 234 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CYP11A1P05108 521 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 JMJD7P0C870 316 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BMP4P12644 408 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NTF4P34130 210 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NLRP12P59046 1061 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MTX1Q13505 466 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MAP7Q14244 749 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MLC1Q15049 377 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 BEND3Q5T5X7 828 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 LINS1Q8NG48 757 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GMCL1Q96IK5 515 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 WDR18Q9BV38 432 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 USP26Q9BXU7 913 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ATG3Q9NT62 314 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.29□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 FAM177BA6PVY3 158 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PPFIA4O75335 1185 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 IGHDP01880 384 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 GNAI2P04899 355 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TCIRG1Q13488 830 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PROSER3Q2NL68 480 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 CEP85Q6P2H3 762 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 IL17RAQ96F46 866 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 MEIS3Q99687 375 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 PALLDQ8WX93 1383 aa7.28□□□□□ -1.24
FOXN3-215ENST00000557261 C4AP0C0L4 1744 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 C4BP0C0L5 1744 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 DLL1O00548 723 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 FSCN2O14926 492 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ADAM11O75078 769 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 APBA3O96018 575 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 NUCB1Q02818 461 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 TIFAQ96CG3 184 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 USP44Q9H0E7 712 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 DCTPP1Q9H773 170 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 VTA1Q9NP79 307 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 USP16Q9Y5T5 823 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 GRM8O00222 908 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 SHOXO15266 292 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 AOC2O75106 756 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 MYL1P05976 194 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 DHCR24Q15392 516 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 BBS9Q3SYG4 887 aa7.26□□□□□ -1.25
FOXN3-215ENST00000557261 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms