RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 FBXL16Q8N461 479 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 MYLIPQ8WY64 445 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ITGB5P18084 799 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 RPS6KB1P23443 525 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PSMA5P28066 241 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 APOBRQ0VD83 1088 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 BRF1Q92994 677 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 BARHL2Q9NY43 387 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.31■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 STXBP3O00186 592 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 CKBP12277 381 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 HOXC8P31273 242 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 HIC1Q14526 733 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.3■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 FOSL2P15408 326 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 KCNA2P16389 499 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ADCY7P51828 1080 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 MTMR1Q13613 665 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 GPNMBQ14956 572 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 JADE2Q9NQC1 790 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.29■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 NID2Q14112 1375 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 MAFGO15525 162 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ATP9AO75110 1047 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SP4Q02446 784 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SERINC5Q86VE9 423 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 WNT8BQ93098 351 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.28■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SMCO2A6NFE2 343 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 BAIAP3O94812 1187 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 CXCL10P02778 98 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 RABGGTBP53611 331 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TRIM50Q86XT4 487 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SLC9A7Q96T83 725 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.27■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 NBNO60934 754 aa22.26■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 AP3B2Q13367 1082 aa22.26■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.26■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.26■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SCN5AQ14524 2016 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SCG2P13521 617 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 EVCP57679 992 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PGBD1Q96JS3 809 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ANO3Q9BYT9 981 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.25■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 TREHO43280 583 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 GNAT1P11488 350 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 MYOGP15173 224 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SREBF1P36956 1147 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 THPOP40225 353 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 RUFY3Q7L099 469 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 SETD4Q9NVD3 440 aa22.24■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 ESYT2A0FGR8 921 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 MBTPS1Q14703 1052 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 PKN1Q16512 942 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CEP55Q53EZ4 464 aa22.23■■□□□ 1.15
CBLN3-202ENST00000555436 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.23■■□□□ 1.15
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