RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SV2CQ496J9 727 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CPZQ66K79 652 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 EXOC2Q96KP1 924 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SAMD11Q96NU1 681 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 AKT3Q9Y243 479 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 A0A087X0B3 334 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MATN3O15232 486 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PDGFRBP09619 1106 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PLS3P13797 630 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 STAT3P40763 770 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MBLAC2Q68D91 279 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 LGI4Q8N135 537 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 KYQ8NBH2 561 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 C8orf49Q96NF6 230 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MMP19Q99542 508 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 KCNH1O95259 989 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ZNF20P17024 532 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FAM209AQ5JX71 171 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FAM124AQ86V42 546 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MIB1Q86YT6 1006 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TTLL6Q8N841 843 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 DPF3Q92784 378 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 COPS5Q92905 334 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CDC6Q99741 560 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 INVSQ9Y283 1065 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MROH6A6NGR9 719 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SGSM2O43147 1006 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 FGFR1P11362 822 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PPP2R2AP63151 447 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SCRN1Q12765 414 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CCDC181Q5TID7 509 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MCTP2Q6DN12 878 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 BORAQ6PGQ7 559 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 STK32CQ86UX6 486 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 BTG4Q9NY30 223 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ITGAVP06756 1048 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 THBDP07204 575 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CHST13Q8NET6 341 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 SEC14L1Q92503 715 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 ZNF536O15090 1300 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-218ENST00000552346 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 C22orf46C9J442 243 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 RAPGEF3O95398 923 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 SOX5P35711 763 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 ITGA1P56199 1179 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 RNF180Q86T96 592 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 BVESQ8NE79 360 aa7.21□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 PDE8AO60658 829 aa7.2□□□□□ -1.26
USP15-218ENST00000552346 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms