RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 CYFIP1Q7L576 1253 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SPATA33Q96N06 139 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SDF4Q9BRK5 362 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GJB4Q9NTQ9 266 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ALPK3Q96L96 1907 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 NFASCO94856 1347 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FAM86B1E9PN63 330 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MMP3P08254 477 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MYL3P08590 195 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 KCNA2P16389 499 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PTGS1P23219 599 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CUL4AQ13619 759 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ITGA7Q13683 1181 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SNX17Q15036 470 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SNX21Q969T3 373 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TBC1D22BQ9NU19 505 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 BTBD18B2RXH4 712 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ARVCFO00192 962 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TLR3O15455 904 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ATP9AO75110 1047 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ARP10275 920 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CYP3A7P24462 503 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GJB2P29033 226 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 INF2Q27J81 1249 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PRR16Q569H4 304 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 NEK8Q86SG6 692 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 HSCBQ8IWL3 235 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 OXER1Q8TDS5 423 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SEPT1Q8WYJ6 367 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TOX2Q96NM4 488 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 H3BQV1 296 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SORBS3O60504 671 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PDCP20941 246 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CDK7P50613 346 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FOSBP53539 338 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 RTP1P59025 263 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GUCY1B3Q02153 619 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 NR5A1Q13285 461 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 LETM2Q2VYF4 491 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 Q4G0T1 1027 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TNFRSF25Q93038 417 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 GPR20Q99678 358 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 H3BRB1 525 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 F2P00734 622 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 KRT76Q01546 638 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SP4Q02446 784 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TRIM60Q495X7 471 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 FAM20AQ96MK3 541 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 MBOAT7Q96N66 472 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 RIT2Q99578 217 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-224ENST00000551155 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms