RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	PLAA	Q9Y263	795 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-231	ENST00000544125	NPTXR	O95502	500 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	C8A	P07357	584 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	JMJD7	P0C870	316 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ATF2	P15336	505 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KCNA6	P17658	529 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FBLN1	P23142	703 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	JAM2	P57087	298 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	GRIN1	Q05586	938 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF460	Q14592	562 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	MIB1	Q86YT6	1006 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CD244	Q9BZW8	370 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	LTF	P02788	710 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KRT1	P04264	644 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	STAT5A	P42229	794 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	NEK4	P51957	841 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	GYS2	P54840	703 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FOXO4	P98177	505 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KCTD1	Q719H9	257 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	MFSD3	Q96ES6	412 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125		M0R2C6	588 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KCNK3	O14649	394 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	AMY2A	P04746	511 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	AMY2B	P19961	511 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	LIMS1	P48059	325 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	NKX3-2	P78367	333 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KCNA10	Q16322	511 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	DTL	Q9NZJ0	730 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	RFXAP	O00287	272 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	MAN2B1	O00754	1011 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CYP2C8	P10632	490 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	PI3	P19957	117 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SSPN	Q14714	243 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CABP5	Q9NP86	173 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	C8B	P07358	591 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	EPHA5	P54756	1037 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00310	P59036	64 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	CR1L	Q2VPA4	569 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FIGN	Q5HY92	759 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TEPP	Q6URK8	271 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-231	ENST00000544125	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37

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