RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 MTMR1Q13613 665 aa28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 PFKFB2O60825 505 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC34A2O95436 690 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 LGALS2P05162 132 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 CCL23P55773 120 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 SZT2Q5T011 3432 aa28.4■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 NEK4P51957 841 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 ARHGAP4P98171 946 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 HIC1Q14526 733 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 SESTD1Q86VW0 696 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM50Q86XT4 487 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.39■■■□□ 2.14
TM7SF3-210ENST00000542019 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CTDNEP1O95476 244 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ARP10275 920 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ME3Q16798 604 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 NECAB1Q8N987 351 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CDHR1Q96JP9 859 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.38■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 DEXIO95424 95 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ACRP10323 421 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 GNA11P29992 359 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ANKRD1Q15327 319 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 PTGISQ16647 500 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CEP55Q53EZ4 464 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM199Q8N511 208 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 SCLYQ96I15 445 aa28.37■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM86B1E9PN63 330 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 C7orf31Q8N865 590 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 VWCEQ96DN2 955 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 KIF2CQ99661 725 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.36■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 H3BRB1 525 aa28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 NLRP5P59047 1200 aa28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 NPY5RQ15761 445 aa28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 MEIS1O00470 390 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 EDIL3O43854 480 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM240Q5SV17 173 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 UIMC1Q96RL1 719 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 NOD1Q9Y239 953 aa28.34■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 MAFGO15525 162 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 CYP3A4P08684 503 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ST3GAL1Q11201 340 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 WNT8BQ93098 351 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.33■■■□□ 2.13
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF76P36508 570 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 BICD2Q8TD16 824 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 GTF3C6Q969F1 213 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 IL23AQ9NPF7 189 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 STK36Q9NRP7 1315 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.32■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 M0R2N6 131 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 CDKL5O76039 1030 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF365Q70YC5 407 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SCN5AQ14524 2016 aa28.31■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 MCTP2Q6DN12 878 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.3■■■□□ 2.12
TM7SF3-210ENST00000542019 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms