RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533025.1

YPEL4-208, Transcript of yippee like 4, human

TSL 4

Gene YPEL4, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YPEL4-208	ENST00000533025	ME3	Q16798	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GPR20	Q99678	358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.58	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025		H3BRB1	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	HAS3	O00219	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	LGALS2	P05162	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP2C9	P11712	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	XBP1	P17861	261 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP2C18	P33260	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PTGIS	Q16647	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	MEIS1	O00470	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	LARGE1	O95461	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP3A4	P08684	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	AR	P10275	920 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CSF2RA	P15509	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CCL23	P55773	120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SHH	Q15465	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	WASF1	Q92558	559 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	DTNB	O60941	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	EPHB4	P54760	987 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.55	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	BFSP2	Q13515	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	KIF2C	Q99661	725 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NFASC	O94856	1347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	ACR	P10323	421 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	CIITA	P33076	1130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	USP11	P51784	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	PRR16	Q569H4	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	GLG1	Q92896	1179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	SCLY	Q96I15	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
YPEL4-208	ENST00000533025	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YPEL4-208	ENST00000533025		M0R2N6	131 aa		13.52	□□□□□ -0.25
YPEL4-208	ENST00000533025	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
YPEL4-208	ENST00000533025	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
YPEL4-208	ENST00000533025	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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