RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532612.5

BCO2-215, Transcript of beta-carotene oxygenase 2, human

TSL 1 (best)

Gene BCO2, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCO2-215	ENST00000532612	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	SPATA33	Q96N06	139 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.79	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	MEIS1	O00470	390 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	MSH4	O15457	936 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	MMP3	P08254	477 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF286B	P0CG31	522 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	PDC	P20941	246 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	USP11	P51784	963 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	NEDD9	Q14511	834 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	KCNA10	Q16322	511 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	POTED	Q86YR6	584 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	LENG9	Q96B70	501 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	SDF4	Q9BRK5	362 aa		12.78	□□□□□ -0.36
BCO2-215	ENST00000532612	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CEP290	O15078	2479 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CHMP2A	O43633	222 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	STX6	O43752	255 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ASGR1	P07306	291 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TGFB3	P10600	412 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	MCM7	P33993	719 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CPT1A	P50416	773 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ACLY	P53396	1101 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PSMC6	P62333	389 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	LAMC2	Q13753	1193 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PKP1	Q13835	747 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ZNF174	Q15697	407 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612		Q9Y3F1	56 aa		12.77	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612		A0A1W2PQY0	241 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	MARCH6	O60337	910 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NEMF	O60524	1076 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612		Q4G0T1	1027 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PHF24	Q9UPV7	400 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TCHH	Q07283	1943 aa		12.76	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612		A6NJR5	290 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ZEB2	O60315	1214 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	GAS7	O60861	476 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NFASC	O94856	1347 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	CYP3A7	P24462	503 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	REST	Q13127	1097 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	PPTC7	Q8NI37	304 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	GPR20	Q99678	358 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		12.75	□□□□□ -0.37
BCO2-215	ENST00000532612	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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