RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 C6orf50Q9HD87 102 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SLC34A2O95436 690 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 LGALS2P05162 132 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SREBF1P36956 1147 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGAP4P98171 946 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SCN5AQ14524 2016 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 NECAB1Q8N987 351 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SCLYQ96I15 445 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 UIMC1Q96RL1 719 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 HAS3O00219 553 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 PFKFB2O60825 505 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 ARP10275 920 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 NEK4P51957 841 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 HIC1Q14526 733 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 PTGISQ16647 500 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 NOD1Q9Y239 953 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 PPFIA4O75335 1185 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM199Q8N511 208 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 C7orf31Q8N865 590 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-211ENST00000531385 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 DEXIO95424 95 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CTDNEP1O95476 244 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 NLRP5P59047 1200 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.019e-7■□□□□ 11.3
PTPRU-211ENST00000531385 ME3Q16798 604 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CEP55Q53EZ4 464 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SESTD1Q86VW0 696 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CDHR1Q96JP9 859 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 FAM86B1E9PN63 330 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 GNA11P29992 359 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF76P36508 570 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD1Q15327 319 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM240Q5SV17 173 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 WNT8BQ93098 351 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 H3BRB1 525 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF365Q70YC5 407 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 VWCEQ96DN2 955 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 IL23AQ9NPF7 189 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 MEIS1O00470 390 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ST3GAL1Q11201 340 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 NPY5RQ15761 445 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 BICD2Q8TD16 824 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 KIF2CQ99661 725 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 EDIL3O43854 480 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CDKL5O76039 1030 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 MARK3P27448 753 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 Q7L0L9 218 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 GTF3C6Q969F1 213 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 STK36Q9NRP7 1315 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 TET1Q8NFU7 2136 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 JAK2O60674 1132 aa21.34■■□□□ 1.01
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