RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 MEIS1O00470 390 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SYN1P17600 705 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM2P49736 904 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 PPFIA4O75335 1185 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CLTBP09497 229 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ARP10275 920 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CIITAP33076 1130 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-208ENST00000531226 F2P00734 622 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF286BP0CG31 522 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TBCKQ8TEA7 893 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KAT2BQ92831 832 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR20Q99678 358 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NFASCO94856 1347 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 EDIL3O43854 480 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 USP11P51784 963 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FAAP100Q0VG06 881 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TMX3Q96JJ7 454 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CD4P01730 458 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT2P35908 639 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SP4Q02446 784 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM29Q14134 588 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OXER1Q8TDS5 423 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SDF4Q9BRK5 362 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 HAS3O00219 553 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MMP1P03956 469 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 LGALS2P05162 132 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PSEN2P49810 448 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FOSBP53539 338 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT40Q6A162 431 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX21Q9UL17 535 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0355O15063 1070 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 B4GALT4O60513 344 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD10Q14728 455 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 INF2Q27J81 1249 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR16Q569H4 304 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SESTD1Q86VW0 696 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 LENG9Q96B70 501 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP4BP1P59074 171 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NR5A1Q13285 461 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF25Q93038 417 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C8orf76Q96K31 380 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 H3BRB1 525 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TDP2O95551 362 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NEK8Q86SG6 692 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MBOAT7Q96N66 472 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 GDF15Q99988 308 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SCN5AQ14524 2016 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-208ENST00000531226 RAG1P15918 1043 aa21.57■■□□□ 1.04
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