RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CPLX1O14810 134 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MAFGO15525 162 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CSF2RAP15509 400 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MFSD10Q14728 455 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 LRCH3Q96II8 777 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 C6orf50Q9HD87 102 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 LGALS2P05162 132 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 GNA11P29992 359 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGAP4P98171 946 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 ANKRD1Q15327 319 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CEP55Q53EZ4 464 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 VWCEQ96DN2 955 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MEIS1O00470 390 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 DEXIO95424 95 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CHMP4BP1P59074 171 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM199Q8N511 208 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 AIFM3Q96NN9 605 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 EDIL3O43854 480 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 LARGE1O95461 756 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CTDNEP1O95476 244 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CYP3A4P08684 503 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 NEK4P51957 841 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 HIC1Q14526 733 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 NPY5RQ15761 445 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MCTP2Q6DN12 878 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 KIF2CQ99661 725 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 ALG1Q9BT22 464 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM86B1E9PN63 330 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 H3BRB1 525 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 ARP10275 920 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXC8P31273 242 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CCL23P55773 120 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 PTGISQ16647 500 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 ME3Q16798 604 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.136e-7■□□□□ 10.7
SLC43A3-217ENST00000530005 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 STK36Q9NRP7 1315 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 M0R2N6 131 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SP4Q02446 784 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM240Q5SV17 173 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM50Q86XT4 487 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 C7orf31Q8N865 590 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 BICD2Q8TD16 824 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 PITPNM1O00562 1244 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 DTNBO60941 627 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 CDKL5O76039 1030 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 RBL2Q08999 1139 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 NECAB1Q8N987 351 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 IL23AQ9NPF7 189 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 NFASCO94856 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 ACRP10323 421 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 CIITAP33076 1130 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 NLRP5P59047 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 RASIP1Q5U651 963 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 GPR153Q6NV75 609 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 GTF3C6Q969F1 213 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SCLYQ96I15 445 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SCN5AQ14524 2016 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 ST3GAL1Q11201 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF365Q70YC5 407 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 WNT8BQ93098 351 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC43A3-217ENST00000530005 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms