RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	METTL7B	Q6UX53	244 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	TMTC2	Q8N394	836 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-208	ENST00000527871	TLL1	O43897	1013 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	LPXN	O60711	386 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	LIFR	P42702	1097 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	KCNJ6	P48051	423 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	NEDD9	Q14511	834 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	GPR20	Q99678	358 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	FIBP	O43427	364 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	KRT40	Q6A162	431 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	TREH	O43280	583 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	GJB5	O95377	273 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	RXRA	P19793	462 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	GNAQ	P50148	359 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	LGR5	O75473	907 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	THPO	P40225	353 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	ADAM17	P78536	824 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	GRB10	Q13322	594 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	IKBKE	Q14164	716 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	RAD9A	Q99638	391 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	TNFRSF10A	O00220	468 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	EFCAB14	O75071	495 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	ATP9A	O75110	1047 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	RSPH10B	P0C881	870 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.02	■■■□□ 2.08	not detected	■□□□□ 8.4
RPS2-208	ENST00000527871	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SKAP1	Q86WV1	359 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	CUL5	Q93034	780 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
RPS2-208	ENST00000527871	BMP1	P13497	986 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	TFF2	Q03403	129 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	TRIM50	Q86XT4	487 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	SETD4	Q9NVD3	440 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	CALM1	P0DP23	149 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	CALM2	P0DP24	149 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	CALM3	P0DP25	149 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	ITGB5	P18084	799 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	KCNA2	P16389	499 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	LINC01553	A4QN01	128 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	ERVK-21	P61565	698 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	GPRASP2	Q96D09	838 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	CAND2	O75155	1236 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	FUT2	Q10981	343 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	UBE2S	Q16763	222 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	FAM26D	Q5JW98	314 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS2-208	ENST00000527871	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07

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