RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR20Q99678 358 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 MXRA8Q9BRK3 442 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 C16orf70Q9BSU1 422 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP9AO75110 1047 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 SEC24BO95487 1268 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNA2P16389 499 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 SREBF1P36956 1147 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CCL23P55773 120 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 STK3Q13188 491 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD1Q15327 319 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 PTGISQ16647 500 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 LGALS2P05162 132 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 BICD2Q8TD16 824 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.412e-12■□□□□ 9.2
TSPAN4-217ENST00000527644 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 IL23AQ9NPF7 189 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 H3BRB1 525 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM240Q5SV17 173 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 PITPNM1O00562 1244 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 BFSP2Q13515 415 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CEP55Q53EZ4 464 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 DEXIO95424 95 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 ACRP10323 421 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 ARHGAP4P98171 946 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC155Q8N6L0 562 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 RETREG2Q8NC44 543 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 DOCK5Q9H7D0 1870 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4-217ENST00000527644 MEIS1O00470 390 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 PFKFB2O60825 505 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF76P36508 570 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 AK2P54819 239 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SP4Q02446 784 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SCRN1Q12765 414 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF365Q70YC5 407 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 CAGE1Q8TC20 777 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SCLYQ96I15 445 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAMTS3O15072 1205 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 CDKL5O76039 1030 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 CYP3A4P08684 503 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SEPT1Q8WYJ6 367 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 NLRP5P59047 1200 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 NFASCO94856 1347 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 FGBP02675 491 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 IQCF3P0C7M6 154 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 ARP10275 920 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 RFC2P35250 354 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 PTK7Q13308 1070 aa30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 PFKMP08237 780 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 NEK4P51957 841 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 C8orf34Q49A92 452 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 RASIP1Q5U651 963 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 HERVK_113Q902F9 699 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SDF4Q9BRK5 362 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 RBL2Q08999 1139 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM50Q86XT4 487 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 RASGRP4Q8TDF6 673 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
TSPAN4-217ENST00000527644 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
TSPAN4-217ENST00000527644 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM86B1E9PN63 330 aa30.01■■■□□ 2.39
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM86B2P0C5J1 330 aa30.01■■■□□ 2.39
TSPAN4-217ENST00000527644 HOXC8P31273 242 aa30.01■■■□□ 2.39
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms