RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.82■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PPTC7Q8NI37 304 aa18.82■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.82■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.82■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ELP1O95163 1332 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 FAM205CA6NFA0 338 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MEIS1O00470 390 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MYL3P08590 195 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ARP10275 920 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MCM2P49736 904 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PSMC6P62333 389 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 LAMC2Q13753 1193 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 KRT40Q6A162 431 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CYFIP1Q7L576 1253 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 TBCKQ8TEA7 893 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 LENG9Q96B70 501 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 SPATA33Q96N06 139 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.81■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ZEB2O60315 1214 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MMP1P03956 469 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 XBP1P17861 261 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CIITAP33076 1130 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 NR5A1Q13285 461 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 METTL7BQ6UX53 244 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 KAT2BQ92831 832 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.8■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CABYRO75952 493 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ZNF286BP0CG31 522 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CDK7P50613 346 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 NEDD9Q14511 834 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CDHR1Q96JP9 859 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 GUCD1Q96NT3 240 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MLXIPQ9HAP2 919 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.79■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MAFGO15525 162 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 TDP2O95551 362 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 KRT2P35908 639 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 GUCY1B3Q02153 619 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 INF2Q27J81 1249 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 GPR20Q99678 358 aa18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 BTBD18B2RXH4 712 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ARVCFO00192 962 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 F2P00734 622 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ZNF76P36508 570 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 SP4Q02446 784 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 TLE2Q04725 743 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 CUL4AQ13619 759 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ITGA7Q13683 1181 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 DGKDQ16760 1214 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PRR16Q569H4 304 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 C8orf76Q96K31 380 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 UIMC1Q96RL1 719 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.77■□□□□ 0.6
HACE1-211ENST00000521962 NFASCO94856 1347 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 KPNA6O60684 536 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 USP11P51784 963 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 TRIM50Q86XT4 487 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 MBOAT7Q96N66 472 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.76■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 HAS3O00219 553 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 WNT7AO00755 349 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 LGALS2P05162 132 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 CYP3A7P24462 503 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms