RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.13■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ESYT2A0FGR8 921 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 LGALS2P05162 132 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 AP3B2Q13367 1082 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 MTMR1Q13613 665 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 PTGISQ16647 500 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 C7orf31Q8N865 590 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 VWCEQ96DN2 955 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 IL17RAQ96F46 866 aa16.12■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 CDHR1Q96JP9 859 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.12■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.12■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.12■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF365Q70YC5 407 aa16.11■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.11■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 GPR153Q6NV75 609 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 Q7L0L9 218 aa16.1■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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PDGFRB-202ENST00000517488 GNA11P29992 359 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 AIFM3Q96NN9 605 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFRB-202ENST00000517488 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFRB-202ENST00000517488 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFRB-202ENST00000517488 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFRB-202ENST00000517488 C8orf34Q49A92 452 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 RASIP1Q5U651 963 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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PDGFRB-202ENST00000517488 HERVK_113Q902F9 699 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 WNT8BQ93098 351 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFRB-202ENST00000517488 DEXIO95424 95 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 FGBP02675 491 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP3A4P08684 503 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NLRP5P59047 1200 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ANKRD1Q15327 319 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CAGE1Q8TC20 777 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 EDIL3O43854 480 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 LARGE1O95461 756 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CTDNEP1O95476 244 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 HOXC8P31273 242 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NEK4P51957 841 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PTK7Q13308 1070 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 GPNMBQ14956 572 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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