RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 MMP1P03956 469 aa22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 KRT40Q6A162 431 aa22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 TMEM199Q8N511 208 aa22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 AIFM3Q96NN9 605 aa22.97■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.96■■□□□ 1.27
USP53-208ENST00000514305 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 STAM2O75886 525 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PDE4DQ08499 809 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 ITGA7Q13683 1181 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 UBE2SQ16763 222 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PXMP2Q9NR77 195 aa22.95■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 DLL1O00548 723 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CCND2P30279 289 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 STXBP2Q15833 593 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 ANO3Q9BYT9 981 aa22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CD4P01730 458 aa22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PTGS1P23219 599 aa22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 FOSBP53539 338 aa22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 NR3C2P08235 984 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CSF2RAP15509 400 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CPT1AP50416 773 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 HIPK3Q9H422 1215 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 DTNBO60941 627 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 GUCY1B3Q02153 619 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PGM5Q15124 567 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 GNPTABQ3T906 1256 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 MCTP1Q6DN14 999 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 COL20A1Q9P218 1284 aa22.91■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 CYP2C18P33260 490 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 ZNF76P36508 570 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 USP11P51784 963 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 SCFD2Q8WU76 684 aa22.9■■□□□ 1.26
USP53-208ENST00000514305 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 BTBD18B2RXH4 712 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 EDNRBP24530 442 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 DNAJB2P25686 324 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 SREBF1P36956 1147 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 PSMC6P62333 389 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TMEM240Q5SV17 173 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NLRX1Q86UT6 975 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 CDHR1Q96JP9 859 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TMEM260Q9NX78 707 aa22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 GRIN2DO15399 1336 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 M0R2N6 131 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MAFGO15525 162 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 STX6O43752 255 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 B4GALT4O60513 344 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 MYL3P08590 195 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 ACRP10323 421 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 SYT1P21579 422 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TIE1P35590 1138 aa22.88■■□□□ 1.25
USP53-208ENST00000514305 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.88■■□□□ 1.25
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